嗓子疼，高烧39℃的治疗。根据描述想到是急性炎症，而且这种急性炎症的感染可能相对严重。
可能是急性化脓性扁桃体炎，或急性咽炎，如果有呼吸困难、呼吸急促等情况，可能是急性会厌炎，甚至会厌囊肿。
所以治疗上要控制抗生素激素的静脉使用，主要是头孢抗生素、地塞米松等。同时可以用抗生素激素的雾化吸入治疗，使用清热解毒的中成药辅助治疗，比如蓝芩口服液、普地蓝口服液等。
要观察病情的发展，如果持续高热不退，可以做电子喉镜的检查，看咽喉部的具体情况。如果经过输液治疗，病情得到控制，可以转化为口服药物进行治疗。