输卵管妊娠流产，顾名思义就是输卵管内的异位妊娠发生的流产。它多见于妊娠8-12周的输卵管壶腹部的妊娠，受精卵种植在输卵管黏膜的皱壁里，由于蜕膜形成的不完整，它发育中的胚泡经常向输卵管的管腔内突出，最终可以突破包膜而出血，胚泡和管壁剥分离。
如果整个胚泡剥离落入管腔，刺激输卵管逆行的蠕动，经过输卵管伞端排到腹腔，就形成了一个输卵管妊娠的完全流产，这样的流产一般出血不多。如果胚泡剥离不完整，妊娠产物部分排排出到腹腔，有一部分还附着在输卵管的管壁上，形成了一个输卵管妊娠的不全流产。
滋养细胞它可以继续侵蚀输卵管的管壁，可以导致反复得出血，这个出血量和持续的时间与残存在输卵管管壁上的滋养细胞的多少有关系。如果输卵管伞端堵塞，血液不能流入腹腔或者盆腔而积聚在输卵管内，可以形成一个输卵管的血肿，或者输卵管周围的血肿。
如果血液不断地流出，并继续在直肠子宫陷窝，可以造成盆腔的积血和血肿，量多的时候甚至可以流到腹腔。