霉菌性阴道炎在月经期也可以使用药物，只不过在月经期使用药物的方式和途径有所不同。在月经期可以用药液进行局部擦洗，而阴道内是不宜上药的。
患者需要穿宽松、透气的内裤，穿宽松、透气的卫生巾、卫生护垫可以采用口服的消炎药，就避免了局部使用栓剂。栓剂在月经期使用起来疗效不确切，也容易引起继发性的感染，所以使用口服药液加上外阴的擦洗，有利于炎症的及早控制，也可以缓解局部不适的症状。