怀孕空囊考虑是胎停育的表现。胎停育常见的因素是胎儿染色体异常，胚胎因素或胎儿染色体异常是早期流产、胎停育的常见因素，比如18三体综合征、13三体综合征、21三体综合征都是常见的原因，还有染色体平衡易位、倒置缺失或者重叠等因素都可能引起。
感染或者药物等因素，也可能引起胚胎染色体异常，出现空囊或已退化的胚胎导致自然流产或不全流产。如果母亲有其他疾病，比如严重感染、高热、贫血较严重、心衰。慢性消耗性疾病、慢性肝肾疾病、高血压严重者，都有可能出现空囊或者自然流产的因素。
如果子宫发育畸形、子宫发育不良、双角子宫、单角子宫、子宫纵隔等，都有可能出现胚胎着床发育受限，出现空囊。如果母亲有免疫系统疾病，比如抗磷脂综合征或者狼疮抗凝血因子阳性的病人，也可能会出现胚胎发育异常。
如果长期在射线或者有毒物质环境中，出现以胎发育异常的情况，也是比较常见的情况。