支原体病情严重程度的不同，发热持续的时间也不同，短则2-3天，病情重时可持续10天。若患者体质差或者不配合治疗，则发热持续的时间还会更长。
当患者确诊为支原体的感染后，需要根据病情采取相应的治疗。例如患者病情较轻，可口服阿奇霉素、红霉素、左氧氟沙星、莫西沙星。如果经过上述治疗无效或病情较重时，可使用静脉的红霉素、阿奇霉素以及喹诺酮类的左氧氟沙星、莫西沙星等等。但在使用抗支原体药物时要注意相关的副反应，例如阿奇霉素、红霉素，常有血管刺激症状以及胃肠道的副反应，出现上述副反应时，需要减慢输液的速度。如使用到大环内酯类的药物，建议在饭后使用。喹诺酮类的药物禁忌症是年龄小于18岁或大于80岁、有癫痫病史者禁止使用，喹诺酮类药的副反应包括心悸、头晕等等。静注喹诺酮类药物，至少要1-1.5个小时，输液速度快也会引起副反应的发生。
患者应注意，其中肺炎支原体传染性较强，家庭成员中有肺炎支原体感染患者，应注意呼吸道隔离，对患者所用物品可用常用消毒剂或高温蒸煮进行消毒。解脲脲原体、生殖支原体等泌尿生殖系统支原体感染，应根据药敏试验结果选用阿奇霉素、四环素等抗生素治疗，应注意配偶或性伴侣共同治疗。