小儿抗生素的药物有很多，常用比较安全的有头孢菌素类、青霉素类、大环内酯类，口服的头孢菌素药物有头孢拉定、头孢克洛、头孢克肟、头孢丙烯等，静脉常用的头孢菌素有头孢曲松、头孢哌酮钠舒巴坦钠、头孢唑肟、头孢西丁等。
临床常用口服的青霉素类抗生素有阿莫西林、阿莫西林克拉维酸钾等，常用静脉的青霉素类药物有美洛西林、哌拉西林、苯唑西林等，常用口服的大环内酯类抗生素有阿奇霉素、罗红霉素、依托红霉素等，常用静脉的大环内酯类抗生素有阿奇霉素、红霉素等。另外，还有一些抗生素因为毒副作用过大，一般不应用于儿童比如氨基糖苷类，如庆大霉素、阿米卡星等，四环素类抗生素容易抑制儿童骨骼生长。