手术都有一定的风险，咽喉部囊肿虽是一个创伤较小的手术，但其风险也存在于两方面。第一、该手术一般是在全麻下进行，有麻醉风险，严重时麻药过敏可出现呼吸心跳暂停，虽发生率较低，但仍需引起重视，完善术前检查，特别是心、肺功能检查。第二、手术本身可能存在的风险以及并发症，咽喉部囊肿可通过支撑喉镜下低温等离子射频消融来进行。支撑喉镜为一硬管镜，容易对牙列、舌体和口角造成软组织损伤，虽术后一段时间可得到恢复，但仍有局部损伤造成疼痛的可能。第三、在进行咽喉部的手术时，会损伤周围一些黏膜，造成术后局部充血、水肿，术后会有呼吸、吞咽受限的可能，需要在医生指导下积极使用抗炎和消肿药物。