肝内胆管结石，主要采取手术的方法。手术方法主要以下几种：第一、高位胆管切开取石术。第二、胆肠内引流术。第三、去除肝内的感染性病灶。第四、微创保肝取石，也就是在内镜逆行性胆胰管造影的基础上切开或者引流胆管，同时进行肝内胆管的取石术。一旦患者在手术后经过T管造影，被发现有胆道残余的结石时，可在窦道形成后拔除T管，经过胆道插入胆道镜，在直视的情况下用取石钳、网篮进行结石的取出。如果结石过大，可以采用激光碎石、微爆碎石或者其他方法，将残留的石头爆碎成小块之后再进行取出。不管怎么样，肝内胆管结石的治疗的原则就是要尽可能的取净结石，解除胆道狭窄和梗阻，吸出肝内的感染病灶，建立和恢复通畅的胆汁引流，并且有效地预防复发。