肛瘘患者一般建议手术治疗，术后可加用二代头孢类抗菌药物进行控制感染，待病情好转后，可改用口服消炎药。可以术后加用通便的药物，比如乳果糖口服液、聚乙二醇电解质，行通便治疗。便后可用高锰酸钾1:5000温水坐浴，保持外阴部清洁。如果条件合适，可给予抗生素软膏热涂。一般情况下，肛瘘都需要手术治疗，行保守治疗很难治愈。如患者强烈要求行保守治疗，可给予口服抗菌药物治疗，如二代头孢控制感染，但一般效果不是特别好。所以，建议肛瘘患者首选手术治疗。