牙菌斑的科学定义，目前的观点来看，认为是一种微生物共同体，应该是以一种或者多种的微生物共同体，包裹在自身分泌的叫多糖基质的东西里。患者不用去深究，知道是被包裹在物质内，附着在牙齿或者修复体像牙冠固体的表面，不能被水冲去，或者漱掉的细菌生物膜就行了。细菌的群落不同于单个的细菌，或者是少数的悬浮的细菌，很多细菌或者很多种细菌黏附在一起互相生长、互相附着的非常紧，很难清除。
菌斑平时用肉眼很难发现，可以通过菌斑染色剂发现，清除只能通过认真的刷牙，或者是别的方式祛除，用专业的口腔节制的方式祛除。患者希望通过漱口，或者简单的方式能祛除，其实是非常难的，刷牙也很难充分的祛除。当菌斑逐渐积累的量比较多，逐渐的吸收钙盐，钙化以后，就会形成牙石。这是一个比较长的过程，不会1-2天就形成，牙石就是肉眼可以看到的，龈上牙石不太容易看到，要通过用牙周洁治的方法祛除。