胃神经官能症的治疗主要是抗焦虑、抗抑郁的治疗，同时也要保持愉悦的心情。胃神经官能症主要的原因是患者情绪过于紧张、焦虑所导致，具体治疗方法如下：
1、抗焦虑的药物：应用舍曲林、复哌噻吨美利曲辛等等进行治疗。
2、质子泵抑制剂：如果患者出现严重的腹胀、嗳气、反酸、呕吐等等症状，也可以使用质子泵抑制剂，抑制胃酸的分泌，或者使用H2受体拮抗剂抑制胃酸的分泌，比如铝碳酸镁、铝镁悬混液等等，保护胃黏膜，使用莫沙必利、多潘立酮等等药物促进胃动力。
3、改善睡眠的药物：如果患者有失眠的情况，也可以适当的使用地西泮进行改善睡眠的治疗。