造成胃蛋白酶原1低的因素可能是胃部疾病，胃蛋白酶原1是用来测胃酸细胞分泌胃酸的能力的，当胃酸分泌增加时胃蛋白酶原1增加，胃酸分泌减少胃蛋白酶原1减少。胃蛋白酶原1低表明有黏膜萎缩，在萎缩性胃炎中是常见的，如果低的不多可能会有检测误差或者可能是小胃病引起，建议半个月内检查一次。
如果伴有胃部不适和消化不良症状，建议进行胃镜检查，可能导致消化功能异常导致消化不良。一些胃病，如萎缩性胃炎，使胃黏膜处于长期损害状态，导致胃酸分泌过少，造成胃蛋白酶分泌减少使胃蛋白酶原1低。造成胃蛋白酶原1低的因素很多，一定要查清后对症治疗。