利拉鲁肽长期使用的副作用主要是胃肠道反应，但是很多患者随着时间的延长，症状大部分能缓解、耐受。利拉鲁肽主要的副作用就是胃肠道的反应，可以出现上腹部的疼痛、恶心、呕吐,甚至腹泻，也有些人出现便秘。很多人一开始使用小剂量，根据治疗的效果以及患者耐受的情况逐渐增加，都会使利拉鲁肽带来的胃肠道反应逐渐减轻、耐受。
另外利拉鲁肽的使用也会出现其他的副作用，比如可以造成心动过速，有些人出现头疼、困倦、头晕、乏力，有些人由于个体差异还可以出现过敏，出现皮疹。另外，利拉鲁肽单独使用或者是和其他的降糖药联合使用，要注意避免低血糖。