避孕药的副作用会持续多久，主要根据避孕药的种类不同，持续时间也不相同，一般短效避孕药副作用在体内持续的时间在半年之内，如果是紧急避孕药，副作用持续的时间一般是在3个月之内。紧急避孕药主要的避孕机理就是抑制卵巢排卵，或者使子宫内膜出现异常增厚，阻止受精卵着床，在临床上达到避孕的作用。既然阻止卵巢的排卵，就使卵巢自然排卵规律受到抑制，造成内分泌紊乱，会导致月经紊乱、月经淋漓不尽或者不规则阴道出血，这种情况一般在3个月经周期之后就会恢复正常。