脑部彩超主要是指经颅多普勒检查，因为颅骨比较厚，超声很难通过，所以超声只能通过特定的声窗进行相应的检查，比如经颅多普勒检查，只能看到一部分脑内大血管的情况，通过判断血流的速度、血流的频谱，判断是否有脑部供血不足的情况。
脑部的核磁共振检查，是对整个的脑部组织进行检查的一种方式，检查的范围是比较广泛的，观察的内容也比较多。不但可以判断患者脑部实质是否有一些病变，还能够观察患者是否有脑梗塞、脑出血等情况，但是看不到具体的脑血管有什么病变。如果想看具体的脑血管病变，需要做脑血管的核磁共振检查。