肛瘘不开刀的方法就是保守治疗，包括调节饮食，用中药或其它药物进行坐浴，肛门内用消炎药膏和药栓等。因为肛瘘通常是指肛管、直肠内，和外界皮肤通过内口、瘘道和外口相联通，绝大部分肛瘘都要通过手术治疗来解决。对于比较早期的肛瘘，或者是症状比较轻的新鲜肛瘘，通过保守治疗，可以不开刀，能够自愈。一般要保持良好的生活习惯，吃清淡饮食，不能吃辛辣或者刺激性强的食物，防止便秘。
另外要多喝水，多吃新鲜蔬菜和水果。还可以用中药制剂或高锰酸钾制剂等进行盆腔和会阴部的坐浴，一方面可以促进肛门直肠周围的血液循环，另一方面也可以局部消毒、杀菌等，促使肛瘘愈合。还有就是可以局部用痔疮膏和痔疮栓，抹在肛瘘的内口、外口以及塞到直肠里，可以局部进行消炎、消肿，促使愈合。绝大部分肛瘘通过保守治疗无效，最终还是要采用手术治疗。