婴儿感染性腹泻给予有效的抗生素治疗，同时给予对症治疗。婴儿腹泻伴有发热时，体温超过38.5℃，给予对乙酰氨基酚或者布洛芬治疗；伴有呕吐者，给予吗丁啉口服，每公斤体重0.3mg每次；伴有腹痛者，轻者可给予颠茄片，大于5岁时给予1/2片，重症者可给予山莨菪碱，肌注每公斤体重0.1mg每次。腹泻严重时可给予有效抗生素的情况下，可给予止泻药物，一般不用单纯止泻药物治疗。肠道微生态疗法，此类患儿多伴有肠道微生态的紊乱或者微生态失衡，可给予双歧杆菌三联活菌颗粒治疗。