系统性红斑狼疮，如果未经有效治疗，则其生存时间相对较短，预后较差。可伴有肾衰竭、继发感染等，导致死亡。但是经过系统早期治疗，可以明显减少患者死亡率，改善预后。
对于系统性红斑狼疮患者，一般强调早诊断，早治疗。在疾病活动期，主张患者以休息为主，积极治疗。缓解期可适当参加工作和学习。无论初发还是复发患者，都建议在专业医生指导下，根据临床症状，以及实验室的指标，进行药物调整。常参考的实验室指标主要有抗ds-dna抗体、补体C3、C4、C50，通常作为评价疾病活动及疗效的指标。系统性红斑狼疮仍然属于不可治愈性疾病，所以维持治疗将直接影响患者的远期预后。有症状的患者建议随时检查。无症状的患者也需要每3-6个月复查实验室指标。
患者平时在生活和饮食上也要注意，夏天出门一定要注意防晒，要涂防晒霜、打伞，以免长期在阳光暴晒下加重狼疮出现。饮食要尽量少进食感光食物，比如在白天时候要尽量避免食用芹菜。患者不宜染头发，且应尽量少化妆，对狼疮的患者来说化学的物质可能是致命性的打击。