婴幼儿补铁的最佳时间应该是在餐后两小时，如果在空腹状态下补铁，补铁的药物通常会刺激小儿胃肠，孩子很容易发生恶心、呕吐或者腹泻的现象，容易影响药物的吸收。
为了避免食物对药物造成影响，容易影响药物发挥最佳的生物利用度。如果在进食之后立即口服铁剂，很容易影响药物吸收，会影响药物的效果。所以应该在餐后两小时食物适当消化，同时也并不是空腹状态下进行口服，既不会刺激小儿胃肠，也有利于药物的吸收以及发挥药物最佳的效果。
补铁的同时应该配合维生素C共同进行补充，维生素C有利于药物的吸收，有利于铁的吸收。