新型冠状病毒肺炎和普通感冒的发烧，一般来说，没有明显的区别。如果想区分二者，要用RTPCR或者高通量测序的方法，检测患者的鼻咽拭子、痰、血标本、尿、粪便的标本，来检测新型冠状病毒的核酸，如果核酸检测是阳性，一般就高度可疑新型冠状病毒感染。如果是肺部CT上再出现了肺炎的斑片影，就可以确定是新型冠状病毒引起来的肺炎。
新型冠状病毒肺炎其常见的症状是发热、干咳、乏力，当然，也可以见到上呼吸道感染的症状，比如鼻塞、流涕、咳嗽、咯痰、发热、全身酸痛、头痛等，也会见到腹痛、腹泻等消化道的症状，有极个别的病人表现为嗅觉、味觉的减退或者丧失。因此，在临床上的鉴别主要还是根据核酸的检测。