糖尿病肾病的治疗需要合理的控制血糖、血压，以及血脂。在控制血糖的治疗中，多项研究显示SGLT-2类的药物有降糖之外的肾脏保护作用。因此，对于伴有糖尿病肾病的2型糖尿病患者，推荐在肾小球滤过率≥45ml/min的患者中使用SGLT-2，GLP-1也可以减少糖尿病患者新发大量白蛋白尿的风险，肾小球滤过率≥30ml/min的患者中，也可以考虑使用GLP-1类的药物。
对于肾功能不全的患者，应该优先选择从肾脏排泄较少的降糖药物，对于严重肾功能不全的患者应该采取胰岛素治疗。对糖尿病伴高血压，且肾小球滤过率＜60ml/min，UACR＞300的患者强烈推荐ACEI，或者血管紧张素Ⅱ受体拮抗剂、ARB类的药物治疗。