酒精棉球塞耳朵临床上主要用于外耳道的消毒，在耳鼻喉科经常有使用的。但是如果操作不当也可能会引起以下的危害：1、酒精棉球所用的酒精是医用酒精，有的患者如果自行购买工业酒精，或者浓度比较大的酒精进行塞耳朵，非常容易损害耳道以及鼓膜，导致患者出现耳道内剧烈的不适感。2、用酒精棉球塞耳朵的时候，酒精棉球应该保持尽量的干不能太湿。因为湿酒精滴入耳道内容易刺激耳道及鼓膜出现不舒服的感觉。3、如果患者有耳道的损害、破损，或者有鼓膜穿孔的情况，临床上是不建议用酒精棉球做耳道的消毒，因为这种情况下酒精进入鼓室内容易损害鼓膜伤及神经，导致患者出现明显的不适感。酒精棉球的酒精如果遇到破损的伤口，会导致患者出现特别疼痛的症状。可能对患者不能起到消毒作用，反而给患者增加很多痛苦。