肛门上长肉疙瘩，多考虑是痔疮、肛门息肉、尖锐湿疣引起。痔疮引起的肉疙瘩，可采用局部治疗，如肛门区高锰酸钾温水坐浴、中药熏洗，使用痔疮膏、痔疮栓肛门外用。如症状较重，出现剧烈疼痛或便血较多，需行手术治疗。
肛门息肉是肛门表面突出的隆起性病变，出现肛门息肉需及时将息肉进行切除，小的息肉单纯电烧切除即可完成治疗。如果息肉基底部较大，需行局部切除，并将息肉送病理检查，如为恶性行根治性的手术及术后综合治疗，肛门的尖锐湿疣多采用电烧切除。