女性雌激素低会对全身各器官多少都有一些影响，在生殖系统方面常常会导致经量减少，甚至停经。有时会导致阴道分泌物减少、白带减少，阴道干涩，甚至影响性生活导致性生活困难。
长时间的雌激素低一般会导致乳腺逐渐萎缩，另外也常常会有植物神经功能紊乱表现，表现为更年期综合征、潮热、出汗、失眠、烦躁等等。
雌激素低的女性衰老快，面色会黯淡无光、面色发黄，也影响骨代谢，有时会引起骨丢失造成骨质疏松。