肝癌出现甲胎蛋白正常，也很常见，不是所有的肝癌患者甲胎蛋白都会升高，临床大约有15%的肝癌的甲胎蛋白为正常。有些肝内胆管细胞癌的早期，由于检测比较早，甲胎蛋白也为正常。目前只有原发性肝细胞癌，甲胎蛋白才会明显升高。
正常的甲胎蛋白是小于25μg/L，而肝癌的时候一般会大于400μg/L，且伴随影像学的改变。因为正常人体的甲胎蛋白合成受到抑制，当有肝癌或者生殖道胚胎细胞发生癌变时候，血中的甲胎蛋白会明显升高。如果甲胎蛋白升高，还需要结合肝脏的超声、CT、磁共振，来明确是否有肝癌。