精子质量不好，怀孕了不会影响胎儿的发育。由于多数情况下精子出现质量差、畸形时，不会产生精子顶体现象，不会出现精子到达输卵管引起受精现象形成受精卵，多数情况下都是A级快速直线运动的健康精子，才能完成受精任务，所以精子质量不好怀孕了常不影响胎儿的健康。
少数情况下由于酗酒、抽烟、X射线照射引起的精子质量差，常会导致DNA突变，这种情况下会出现胎儿畸形，所以在准备要孩子的前三个月，不能抽烟、酗酒、不能照射射线。