小孩咽口水时喉咙痛，可能是咽部的炎症，这个年龄段抵抗力差，咽喉有炎症，在咽口水、吞咽的时候就会出现疼痛的感觉，主要考虑以下原因：
1、细菌感染：链球菌感染引起的猩红热，早期的时候表现为咽炎，临床上还会有发烧、鲜红粒样皮疹等症状。
2、病毒感染：EB病毒感染，它是嗜淋巴细胞病毒，早期出现咽部的炎症，发烧迟迟不退，会伴有淋巴结肿大、肝脾肿大，外周血象里有异常的淋巴细胞等。出现这些现象时，EB病毒感染的诊断基本就会明确。柯萨奇病毒引起的疱疹性咽峡炎，咽部出现疱疹，也会出现发烧、咽口水时出现咽部的疼痛等症状。
要请医生协助分析，必要的时候做检查，明确诊断以后，需要给予针对性的治疗。