肾结石如果合并肾萎缩则属于严重的疾病，此时结石已经造成了器官损害，可能会出现肾功能下降，如果不进行积极有效的治疗则肾功能进一步的损失加重，可有有切除肾脏的风险。肾脏结石造成的肾萎缩大多是因为肾积水引起，因为长时间的积水，肾盂内压力升高，会对肾实质产生一定影响，久而久之就可以导致肾脏实质变薄、肾单位丢失，肾功能就可以出现不可逆转性的损害。严重的可以导致肾脏实质变得如同纸一样薄，肾盂完全扩张，其内积有大量液体甚至可以出现积脓或者肾脏自发性破裂等风险，所以属于严重的病变。建议到医院进行积极评估并采取合适的治疗，比如肾切开取石术、经皮肾镜碎石取石术或者肾脏萎缩部分连同肾脏结石一并切除。