眼角膜溃疡的治疗原则为积极控制感染、减轻炎症反应、促进溃疡愈合、减少瘢痕的形成。角膜溃疡是角膜炎的一个阶段，常见几种角膜炎与其治疗方法如下：
1、细菌性角膜炎：宜选用敏感的抗生素进行治疗，首先临床上会根据经验和疾病的严重程度，使用对病原体有效的广谱抗生素进行治疗，待实验室检查结果证实病原菌以后，再调整给予敏感抗生素进一步治疗，病情严重的患者可以配合全身应用药物。
2、单纯疱疹病毒性角膜炎：需要联用干扰素，可以提高它的疗效。
3、真菌性角膜炎：要针对使用抗真菌药物，严禁使用皮质激素。
防止复发也是角膜溃疡治疗的重点，但目前尚无特效的药物，当药物治疗无效时，溃疡穿孔或者是行将穿孔者，应该采取治疗性的角膜移植术清除病灶，术后继续药物治疗，绝大部分患者可以保存眼球，还可以恢复一定的视力。