有乙肝病毒的患者有抗病毒指征时，服用恩替卡韦的主要作用是将乙肝病毒的复制率压制到最低，以减少对肝脏的损害，但吃恩替卡韦五项转阴的概率极低。
某些患者在长期服用恩替卡韦时，有出现乙肝表面抗原转阴的情况，但其发生概率极低，只有很少数的患者有这种可能性，大部分患者在服用恩替卡韦时是无法将乙肝病毒转阴的，只能将乙肝病毒的复制率压制到正常。
而恩替卡韦的作用主要是能够减少乙肝病毒的复制，对于将来减少乙肝肝硬化，甚至肝癌的概率都是有所帮助的。