孩子发烧两天了，反复烧到39℃，说明病症还没有明显的好转迹象，还没有得到有效的控制，不知道患者做没做相关的检查，最好还是查血项，还有C反应蛋白，这是最简单的检查。根据血检的结果判断到底是感染性的，还是非感染性的，或者判断感染的性质，才能更正确地指导用药。
如果是细菌感染，需要用消炎药，如果是病毒感染，也要判断一下是流感，还是普通的病毒感染，治疗起来也有不同的方法，可以吃清热解毒的中药，像小儿豉翘。体温到38.5℃以上要用退烧药，但是退烧药都是治标不治本，只是暂时的把体温给降下去，不至于对身体造成很大的伤害，但是治本还要判断到底是什么原因引起来的发烧，这样施以正确的治疗方法才能收到比较好的效果。