刚出生的宝宝做心脏彩超没有影响，就心脏彩超这门技术而言，它无创伤、无射线，所以对新生儿做相应的检查比较安全。但如果新生儿是早产、出生体重比较低，以及处在疾病的危重状态，需要到彩超室进行超声检查，此过程可能会造成新生儿低体温、低氧血症等等，这样对新生儿疾病本身就有影响。
就心脏彩超而言，如果能够做到床旁超声检查，无论是对患病中的新生儿或者是体重极低的早产儿，都没有明显的影响，对先天性心脏病或者心功能等相关疾病的诊断是一项常规技术，比较安全和有益。