碘伏涂伤口会有疼痛的感觉，但是可以忍受。
碘伏是临床上常用的消毒类制剂，有较为广泛的抗菌谱，并且有较广泛的抗菌使用范围，比如对于皮肤表面的消毒，对于软组织的消毒，甚至对于胃肠道切口的消毒，都可以用碘伏。碘伏对黏膜以及软组织的刺激相对较小，用碘伏进行伤口清洗时，可以将碘伏进行适当的稀释进行伤口清洗。在清创缝合时，清创操作也常常采用碘伏冲洗伤口的办法，将伤口内的细菌和异物进行一并清除。在碘伏应用之后，有时可以用盐水进行伤口的彻底清洗，如果不进行清洗，也不会对创面造成不利的影响。对于感染性伤口，也可以用碘伏进行伤口内的消毒，消毒之后可以用高渗盐水进行伤口内的湿敷，以加速脓肿伤口的最终愈合。
若伤口较深或因生锈的钉子等物品所伤，在碘伏消毒的同时，还需及时到医院免疫科进行破伤风注射，以免造成严重后果。