对于大多数的肺炎，患者通过联合抗炎治疗，完全治愈以后不会有后遗症，但是一些特定的情况下，部分患者会出现一些后遗症。一般常见的细菌性肺炎，比如金黄色葡萄球菌、克雷伯氏菌、绿脓杆菌、肺炎球菌感染所引起的肺部的炎症。
通过积极的抗炎治疗之后，肺部的炎症完全消除，一般不会留有肺部的纤维化、钙化的病灶，但是极少数患者会出现钙化的遗留陈旧性的病灶，如果范围比较大，很可能会使肺部的呼吸功能下降，引起呼吸功能受限，导致可能会出现呼吸急促、喘息等呼吸困难的症状。此外，特殊的病原体，比如结核杆菌感染引起的干酪性肺炎。
这时肺部的分泌物非常少，会出现干性的增生，治愈之后会留有弥漫性的纤维化、钙化的病灶，会影响到肺功能，导致呼吸困难甚至呼吸衰竭。