药物流产吃药第二天同房，在临床上造成的危害如下：1、第二天在吃米非司酮的时候，宫颈已经出现相对软化，子宫处于相对比较敏感的状态，所以如果同房，同房刺激会造成子宫收缩而导致流产的可能性，往往会出现阴道流血，继而会出现下腹部疼痛，造成流产，这种情况如果阴道流血增多，大于月经量，尽快到医院去给予相应的处理。2、因为此时胚胎在宫腔内基本上已经处于死亡状态，所以如果这个时候同房，病原菌有可能顺着软化的宫颈进入到宫腔，引起感染的可能性。这就是吃药进行药流第二天同房，在临床上造成的危害。