男性尿道刺痛的主要原因，多数是因为泌尿系统感染引起。泌尿系统感染主要是因为抵抗力下降或者局部不卫生，以及不洁性生活之后，导致细菌从尿道口侵入到尿道、膀胱等地方，而形成局部的菌落堆积。
造成相应的黏膜损伤，尿液经过时就会出现明显的尿频、尿急、尿痛，甚至血尿，发热、寒战等全身的炎症反应。可以使用广谱的抗生素，包括头孢二代、三代以及喹诺酮类的药物，来进行对应处理。
还有一部分主要是因为泌尿系统结石或者肿瘤等病变，而导致尿液局部的刺痛不适，可以通过尿常规以及泌尿系统B超和CT，来进一步的明确诊断，积极治疗。