妊娠期甲亢对胎儿的影响主要包括早产、流产、胎儿畸形，以及出生后的新生儿甲亢等。诊断为毒性弥漫性甲状腺肿（Graves病）的孕妇，如果母亲身体中促甲状腺激素受体抗体（TRAB）大于正常参考值的三倍，TRAB就可以通过胎盘进入胎儿循环，引起胎儿或者新生儿甲亢。
除了甲亢病的本身，治疗甲亢的药物，包括甲巯咪唑以及丙硫氧嘧啶也可以导致胎儿发育不良，胎儿畸形等不良后果。同时，抗甲状腺的药物还可以通过胎盘来抑制胎儿的甲状腺功能，导致胎儿或者新生儿甲减。
因此，整个孕期都要定期的监测甲状腺功能、TRAB水平以及定期产检。如果病人的甲亢未控制建议不要怀孕，如果病人正在接受抗甲状腺药物的治疗，需要使血清甲状腺激素的水平达到正常范围。停用抗甲状腺药物治疗三个月后再怀孕，尽可能降低甲亢以及治疗甲亢的药物对胎儿的影响。