孩子反复5天发烧伴有咳嗽时需要及时去医院就诊，检查血常规和肺炎支原体以及甲流和乙流。需要查明病原体，针对病原体选择敏感抗生素，在没有确定是什么病原体感染前还需要对症处理。
发烧时及时给予退烧药控制体温，可以服用布洛芬混悬液或者是复方锌布颗粒，咳嗽时可以服用小儿止咳化痰颗粒或者氨溴索糖浆，也可以服用金振口服液。
如果是支原体感染时要服用阿奇霉素治疗，如果是细菌感染时要服用头孢菌素类的抗生素治疗，如果是病毒感染引起的发烧、咳嗽时，可以服用利巴韦林颗粒治疗，如果是在流感季节由于流感导致的发烧、咳嗽时，需要服用磷酸奥司他韦颗粒治疗。