指甲凹凸不平表现有甲凹点、甲纵沟、甲横沟、甲纹、甲纵裂、甲扁平等，不同的疾病原因不同。甲凹点称为甲凹陷点，本病甲板表面有点状凹陷，如针尖大小，似顶针样改变。甲板其余部分正常，常见于银屑病的指甲改变，也见于湿疹皮炎及斑秃患者。甲纵裂典型者为甲板中央有一纵嵴，嵴顶凹陷为浅沟，也可无嵴而呈显著的沟状纹，发生在一甲或数甲，常因甲母质受损后所致。
此外，也见于扁平苔藓、毛囊角化病等疾病。甲板上出现横行沟称为甲横沟，是由于甲母功能暂时障碍所致，可发生于猩红热、肺炎、麻疹、药疹等全身疾病之后，也可因局部外伤或炎症引起。局部有湿疹、银屑病等病变也可引发，甲凹陷可见于外伤、黏液、囊肿和正中甲营养不良，甲纵纹类似甲纵嵴，可发生扁平苔藓、毛囊角化病、末梢循环障碍等。患者的甲真菌病、外伤感染及内科疾病，均可导致指甲凹凸不平。所以当指甲凹凸不平的时候，建议患者及时到医院做检查，接受正规合理的治疗。