临床上无创呼吸机使用的范围越来越广，一般对于无心跳、呼吸或者自主呼吸微弱以及神志昏迷的患者，不宜做无创通气治疗。对于有肺部感染较重、气道分泌物较多或者存在有误吸高风险的患者，不宜做无创通气治疗，因为患者的气道保护能力差，需要行气管插管、有创通气治疗。
另外，对于有面部严重损伤，不宜佩戴面罩的患者，也不适宜做无创通气治疗。有消化道出血以及自发性气胸，未充分引流的患者不宜做无创通气治疗，因为无创通气可能加重胃肠道胀气以及气胸增加。
有极度紧张，不配合无创通气的患者，也不适合做无创通气治疗，需做患者的解释，争取其配合治疗，才能达到满意的治疗效果。