发生急性鼻窦炎时，主要以药物治疗为主，治疗的原则是改善鼻腔、鼻窦的通气引流，控制感染，防止发生并发症，一定要治疗彻底，如果反复发作，容易转换成慢性鼻窦炎。
可以使用抗菌素、黏液促排剂、短期鼻腔血管收缩剂和生理盐水冲洗鼻腔，效果比较好的有头孢呋辛、切诺、呋麻滴鼻液等。其中鼻腔血管收缩剂应用的周期不应超过7天，长期使用可能会造成药物性鼻炎。
慢性鼻窦炎或经药物治疗效果欠佳的急性鼻窦炎，可以选择手术治疗，术前也可以适当的使用急性鼻窦炎的治疗药物，主要是控制炎症感染，减少术中出血。手术后一定要定期复诊和鼻腔用药，主要是为了清理鼻腔内的干痂，减轻黏膜的肿胀。