甲钴胺是维生素B12的一种类型，它较普通的B12效果要好，它是有活性的。甲钴胺主要应用于各种维生素B12缺乏引起的疾病，临床上广泛的应用于周围神经病的治疗，包括糖尿病性周围神经病，还有免疫介导性的一些周围神经病，如急性格林-巴利综合征和慢性格林-巴利综合征，也应用于神经痛的治疗，和一些外周神经病的治疗，如股外侧皮神经炎等等。
甲钴胺注射液还可以应用于亚急性联合变性，患者主要是由于B12缺乏造成的脊髓后索和侧索的变化。对于这类患者只能应用甲钴胺注射液，口服药物一般效果不佳。此外，甲钴胺注射液还可以应用于严重的贫血，和严重的高同型半胱氨酸血症的患者，因此甲钴胺注射液在临床上应用还是比较广泛。