新生儿出现消化不良，出现上消化道的症状的时候，吃一些助消化的药，像乳酶生、消化酶这一类的，对出现下消化道的吃一些益生菌，吃一些调节类的药，因为小孩刚刚出生，尽量避免应用抗生素这类的药物，除非万不得已的情况下，不要选择一些对小孩有伤害的药物。同时，对小儿消化不良，可以选择一些传统的方法，像小儿推拿治疗小儿的疟疾，小儿的腹部的按揉和小儿手掌的按摩治疗，不过要请专业的医生、专业的推拿师来进行治疗。通过这三种方法，往往患儿能得到很好的改善，能够治好的。