最常见的甲状腺炎叫做桥本甲状腺炎，是一种自身免疫性甲状腺炎，也叫慢性淋巴细胞性甲状腺炎，是日本的学者桥本首先报道这个病，以他的名字命名，主要是由于自身的免疫系统出了问题，免疫系统应该是保护自身的，但有时也会出错，免疫系统把甲状腺的某些成分认为是敌人，产生了自身免疫反应，出现甲状腺滤泡上皮细胞的破坏，引起甲状腺像增大或者萎缩，最后出现甲减，这是最常见的甲状腺炎的一种。
还有一种叫亚急性甲状腺炎，就是过度的劳累、精神紧张、自身的抵抗力明显下降，这时外界的某些病毒就会乘虚而入造成亚急性甲状腺炎，表现为明显的发烧、颈部痛性的包块，而且痛性的包块可以在颈部有左侧变到右侧。根据血液的化验还有甲状腺的吸碘率，可以明显的降低，来进行正确的诊断。造成甲状腺炎还有其它的原因，像产后甲状腺炎，也是一种自身免疫性甲状腺炎，但往往能够自行恢复。因此甲状腺炎根据不同的原因，根据甲状腺功能状态来进行正确的诊断和治疗。