IgA肾病10年肾脏存活率为80%-85%，20年约为65%。但是个体差异比较大，有的病人长期预后良好，但是有的病人快速进展到肾衰竭。
疾病预后不良的指标主要包括持续难以控制的高血压和蛋白尿，尤其是蛋白尿持续大于1g每天的患者，还有肾功能损害以及肾活检病理类型不好的患者，比如肾小球硬化、间质纤维化和肾小管萎缩，或者伴有大量新月体形成，这些情况往往都提示预后不良，这些患者的生存期，比尿蛋白少，病理类型好的，生存期短。
IgA肾病起病隐匿，常常表现为无症状性的血尿，伴有或者不伴有蛋白尿，往往体检时发现，所以体检非常重要，发现尿异常要及时进一步的检查，明确病因，以防止出现严重的不良后果。