小便时出现肾疼是不正常的，如果仅仅是偶尔一次出现这种情况，绝大多数是由于肌肉痉挛等原因造成的，不必过于的担心，只需要继续观察病情的发展情况就可以了。
如果频繁出现肾区疼痛，就需要进行血常规、尿常规、彩超、CT等检查，来明确是否存在相关疾病。常见的疾病包括泌尿系感染、结核、结石、肿瘤等等，只有诊断明确了，才能够进行针对性的处理。
比如泌尿系感染的患者，可以进行抗菌、消炎治疗，泌尿系肿瘤、结石的患者，可以进行相应的手术治疗。病因去除之后，这种临床症状会自行消失。