脑袋后面神经疼主要有两种可能，第一种是枕大神经疼，枕大神经疼分两种情况，病毒感染和其它病原体感染。第二种是颈椎病，颈椎肿瘤压迫到神经根，引起神经根疼痛。
此外，血压的问题也会引起脑后部一阵阵疼痛，血压高或血压低都会引起这样的症状。颅内的病变，特别是颅后部的病变，比如枕叶、小脑或颅底的病变，影响到脊髓和颈椎交界处的神经，也会出现头部的疼痛，可以经过CT或核磁验证。肩颈肌肉劳损的时候，特别是长时间保持一种姿势，看电脑、看手机或写字，也会造成颈部的疼痛，引起后脑勺一阵阵的不适。