衣原体是革兰阴性菌细胞内寄生的微生物，衣原体为独立的目，即衣原体目，它还有一个科，叫衣原体科，一个属，即衣原体属，衣原体属下有四个种，及沙眼衣原体、肺炎衣原体、鹦鹉热衣原体和猫心衣原体。沙眼衣原体又有几个生物变种，即鼠和猪的变种，它不感染人类，还有一种就性病性淋巴肉芽肿变种，它一般是L1到L3等三个血清型，还有沙眼变种，还有A、B、BA、C到K等12个血清型，A、B、BA和C型最常引起沙眼，但它们偶尔也可以从生殖道中分离到，D到K这几种血清型主要为泌尿生殖道感染，其中D、E和F型最为常见。沙眼衣原体引起的疾病范围广泛，可以累及眼、生殖道和其他的脏器。