衣原体是一类细胞内寄生的微生物，沙眼衣原体引起的疾病范围比较广泛，可以累及到眼、生殖道和其他的脏器。在女性引起的疾病包括有症状和无症状的宫颈炎、尿道炎、盆腔炎、肝周围炎。孕妇如果是感染了生殖道衣原体，在分娩的时候经过产道可以传染新生儿，导致新生儿结膜炎和肺炎。男性感染了沙眼衣原体之后，可以引起有症状和无症状的尿道炎、附睾炎、前列腺炎、关节炎、直肠炎、结膜炎等。