女性在月经期可以做B超检查，经期的第2-3天做B超的目的，则是看基础状态卵泡的大小和数目、子宫内膜的厚度，主要适用于试管助孕的病人。这类病人在月经期先做B超，再抽血化验性激素，来决定是否启动试管周期。
还有一类是异常子宫出血的病人，如果病人阴道流血不止，随时都可以做B超检查。这种情况做B超的目的是检查子宫、卵巢有没有占位性病变，查明子宫出血的原因。如果阴道流血比较多，可以憋尿做腹部的B超。如果阴道流血不多，可以做经阴道的B超检查。经阴道的B超检查能免去憋尿的麻烦，随到随做，非常方便。在辅助生殖助孕技术中，病人经常做阴道B超，每个病人做B超前会更换一个避孕套，所以做阴道B超不会感染。